近日，我校中医药创新研究院陈伟课题组在Molecular Therapy杂志(医学领域JCR一区，Top期刊，影响因子8.986)发表了题为"mRNALocater: enhance the prediction accuracy of eukaryotic mRNA subcellular localization by using model fusion strategy"的研究论文。

  RNA分子在细胞中高度不均匀的分布是个体发育、局部蛋白质翻译和染色质3D结构形成的生物学基础。特定RNA分子的亚细胞定位通过影响转录、蛋白质合成，调节了细胞增殖、细胞极性、纺锤体组装、细胞迁移等诸多生物过程。在RNA表达水平较低的情况下，实验技术因敏感性较差、空间分辨率低、亚细胞区域普适性差等弊端，导致其对RNA亚细胞定位的注释存在偏差。因此亟需开发检测RNA亚细胞定位的新方法。  

陈伟课题组基于集成学习策略，通过使用权重加和的方式集成XGBoost、lightGBM和CatBoost算法，开发了一个具有强鲁棒性生物信息学方法mRNALocater，并搭建了在线生物信息学分析平台 (http://bio-bigdata.cn/mRNALocater/)。目前，mRNALocater可以用于识别定位于5个不同亚细胞区域的mRNA。与mRNALoc相比，mRNALocater在4个评价指标参数上都具有较好的性能。mRNALocater的提出为mRNA亚细胞定位研究提供了新方法和重要的技术支持。

                                                   mRNALocater构建流程图     mRNALocater与mRNALoc工具性能比较

科研思路的实现，离不开实验技术的有力支撑。中医药创新研究院一直致力于实验技术新方法的开发应用，此次RNALocater的提出，是在mRNALoc方法上的改革创新，方便生物信息领域研究人员精准定位RNA亚细胞，为后期研究各种疾病的发生、发展提供实验基础。

我校中医药创新研究院助理实验师唐强为本文的第一作者，陈伟教授为本论文的通讯作者。本工作得到了中医药创新研究院生物信息平台、国家自然科学基金委等单位的大力支持。

原文链接：http://lib.cdutcm.edu.cn:7001/rwt/28/https/MSYXTLUQPJUB/10.1016/j.ymthe.2021.04.004

（图、文/中医药创新研究院 陈伟课题组 编辑/科技处 张慧敏）