2024年8月22日，我校中医药创新研究院/交叉学科研究院学者张杨副教授在细胞死亡旗舰期刊《Autophagy》（中科院一区，top期刊）上发表题为Mapping autophagy-related membrane contact site proteins and complexes with AutoMCS Navigator研究短文，医学技术学院2020级本科毕业生潘贤润为论文并列第一作者，张杨为论文通讯作者。

在真核细胞中，膜接触位点（MCSs）通过使细胞器的膜在不融合的情况下靠近，促进了细胞器之间的相互作用和通信，在细胞内运输、信号传导和功能调节中起着关键作用。在最近工作中，团队从文献中汇总了有关MCS蛋白质和复合物的数据，创建了MCSdb数据库（《Scientific Data》，中科院二区）。在数据整理过程中，团队发现许多MCS及相关蛋白质与巨自噬/自噬高度相关。因此，为帮助阐明MCS在自噬中的作用，团队又从MCSdb中重新组织了与自噬相关的MCS蛋白质和复合物，开发了一个名为AutoMCS Navigator的导航地图。该地图包括30个复合物和84种蛋白质，涵盖了13种不同的MCS。同时，还提供了一个精心设计的在线导航工具，精细展示了参与自噬的MCS蛋白质和复合物。总而言之，研究开发了一个用户友好的可视化地图，用于查询、浏览和可视化自噬相关MCS蛋白质和复合物的详细信息。AutoMCS Navigator地址：https://cellknowledge.com.cn/mcsdb/autophagy.html。

图1. AutoMCS Navigator工具示意图。 

此外，2024年7月8日，张杨副教授及团队在《BMC biology》（中科院一区，top期刊）上发表题为Predicting intercellular communication based on metabolite-related ligand-receptor interactions with MRCLinkdb的研究论文。张杨副教授为论文通讯作者。

代谢物相关的细胞通讯在维持人体生物功能中起着关键作用。然而，大多数现有工具和数据库仅关注蛋白质相关配体-受体相互作用对。为填补这一空白，团队开发了MRCLinkdb平台，首先MRCLinkdb汇集并组织了与非蛋白质配体-受体相互作用相关的数据，提供了一种基于代谢物相关配体-受体相互作用预测细胞间通讯的宝贵资源。然后在数据整合基础之上，MRCLinkdb 开发了一个专门用于代谢物相关细胞间通讯预测的算法及在线服务工具。MRCLinkdb网址：https://www.cellknowledge.com.cn/mrclinkdb/。   

相关研究获得国家自然科学基金的资助（62071099, 62202069）。

全文链接：https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.1080/15548627.2024.2394291

          https://link.springer.com/article/10.1186/s12915-024-01950-w