公卫中心是国家感染性疾病临床医学研究中心四川分中心、国家中医药管理局中医药防治传染病重点研究室（临床基地），是省部级重点艾滋病、结核病、肝炎肝病等传染疾病防治平台。建设有西南地区先进的临床检验检测中心、结核分枝杆菌实验室、PCR实验室、艾滋病初筛和确认实验室。设备上，基地配置有ECMO体外膜肺系统、数字减影血管造影机（DSA）、数字化双板X线摄影系统、1.5T磁共振成像系统、3台64排CT、全自动微生物质谱检测仪、荧光胸腔镜、肝纤维超声诊断仪、全自动基因分析仪等满足传染病教学科研的成套医疗设备。现基地编制床位数1100张，设有临床一级科室27个、二级科室61个。具备独立的教学教室15间，病区教学示范室19个，学术报告厅4个，PBL教室1间，医学图书馆1个（其中包括纸质藏书约3000册，并购买医学数据资源，如中国知网，维普数据库，万方数据库，智慧云数据库等，均向所有医护人员及学生免费开放。）